2006年2月20日，银监会召开了2006年全国合作金融监管暨改革工作会议。银监会副主席唐双宁同志也在报告中提出，年底前所有农信社在2006年底前完成贷款五级分类，从2007年实行贷款五级分类为主、两种数据共同报送的“双轨运行”制度。并对农信社贷款五级分类培训、实施、考核、验收等提出具体要求。

　 2006年2月22日，银监会举办了银监局分管局长、合作处长和省级联社理事长、主任参加的首期农信社高级管理人员贷款五级分类培训班，唐双宁副主席就全面推进农信社贷款五级分类的认识问题、操作问题、责任问题发表重要讲话。
　　启动“123工程”农信社2000名骨干到商业银行交流学习。银监会协调中国工商银行、中国银行、中国建设银行以及招商、民生、华夏、浦东、兴业、中信等商业银行，接收农信社2000名管理人员学习贷款风险管理，市场营销、产品研发、中间业务等，并正式印发文件予以专门部署。
　　2006年3月，银监会发布《农村合作金融机构信贷资产风险分类指引》，进一步完善了农村合作金融机构信贷资产风险分类的制度，明确了分类资产范围、分类原则、标准、程序、认定权限、提取拨备等方面重要政策。

　  2006年5月24日，银监会在山东省烟台市召开了农村合作金融机构贷款五级分类工作座谈会。

　　2006年11月至12月，合作部首次运用农信社贷款风险分类偏离度现场检查和统计分析软件，组织完成了对农信社贷款五级分类的偏离度检查，此次贷款五级分类偏离度检查共涉及28个省（区、市）的699家县级机构，占全国2327家县级机构的30％，被查贷款余额为6955.71亿元，占全国贷款余额的33％。根据检查结果推算，全国农信社贷款五级分类的平均偏离度为2.36个百分点。2006年底，被查机构已按照偏离度检查结果对分类不准确的贷款台账进行了调整。

        2006年12月，各级合作金融监管部门和农村合作金融机构圆满完成了全国21300家法人机构的26268亿元贷款五级分类工作，实现了“用一年左右的时间完成由以期限管理为基础的贷款四级分类向以风险管理为基础的贷款五级分类过渡”的工作目标。